內壇為醮典、法會期間醮祭活動的重心所在，通常在舉行醮祭之前才由主持醮祭科儀的道壇臨時搭設，名為結壇，主要可區分為：三清壇、和三界壇兩大部分。三清壇是內壇中進行科儀演法的主要場所，通常搭結於廟宇正殿中，中供（玉清）元始天尊、左供（上清）靈寶天尊、右供（太清）道德天尊。左為玉皇宮，供萬神之主玉皇上帝，右為紫微宮，供萬星之主紫微帝君，以五位聖尊象徵至高至尊諸仙聖眾。在玉皇宮與紫微宮的兩側，則有四幅掛軸，分別繪出天京、地府、水國、陽間諸神，作行進朝見元始天尊狀，屬於行進中朝元仙仗圖的同一譜系。
壇場前方則設有溫、康、馬、趙四官將位，職司護衛壇域之責，正一道派則只設趙、康元帥；有時還會設北斗、南斗星君位。在三清壇前設有洞案（科儀桌），案前即為科儀進行的儀式空間，行科演法及誦經拜懺均在此。如舉行中元普度或超度性質法會，則在三清壇的三清道祖兩旁，左掛救苦天尊像、右掛普化天尊像，乃職司慈悲救苦、賑濟孤幽；而朝元圖也更改為十殿地獄圖，行科誦經也在壇前，但是並未禁止一般信眾的出入。