保生大帝又稱大道公、吳真人等,俗名吳?,出生於宋代太平興國4年(979)三月十五日,為福建同安白礁村人氏。相傳吳?曾醫好宋仁宗皇后的病,亦曾醫治過動物,因此有「點龍眼、醫虎喉」的傳說。在漳、泉二州遭逢瘟疫之時,皆偕門徒深入疫區義診施藥,今日的泉州城內仍保有一座「花橋慈濟宮」,是吳?與門徒於泉州行醫濟世之處,故吳真人又被稱為「花橋公」。宋仁宗景祐3年(1036)五月初二日於青礁其煉丹採藥之處,不慎墜崖飛昇。吳?仙逝之後,百姓感念其恩澤遂於青礁建廟奉祀,後來在祂傳說故事發生之地,也都建有大道公廟奉祀,歷史記載具有規模的廟宇分別有東、西、南、北四大慈濟宮,其中白礁和青礁各是真人誕降及成道之處,因而頗負盛名,成為保生大帝信仰之祖庭。
臺南縣學甲鎮慈濟宮奉祀的主神保生大帝——「開基二大帝」,相傳是吳真人飛昇之後,鄉人立廟時刻有三尊開基神像,其中的「二大帝」則由同安籍之李勝恭迎金身隨著鄭成功之軍隊,於今學甲將軍溪頭前寮渡口上岸。此神本是學甲下社角李姓所私祀,之後逐漸成為學甲當地十三庄人士的共同信仰,並建廟奉祀。清咸豐10年(1860),泉州府晉江縣深滬旅臺信士吳澤津、協慶號商船吳世祥,有感保生大帝之神威顯赫,因此特別自學甲慈濟宮分靈神像及藥簽,恭奉於深滬寶泉庵後殿東軒,今成為該廟之主神。
在清領時期,信眾都能時常回去白礁慈濟宮謁祖,稱為「上白礁」。但日據時期之後兩岸的往來受阻,因此才改到當年祖先登陸之將軍溪畔遙拜。起初並非年年舉辦,但在20世紀後半才逐漸改成每年舉行。除每年固定舉行上白礁及遶境之外,慈濟宮亦不定期會舉行大型的刈香活動,又稱為「學甲香」。每年上白礁的祭典,陣頭遶境區域以學甲及中洲兩庄為主;如舉行大刈香時,三天的遶行區域則涵蓋昔日「學甲十三庄」範圍,甚至廣及學甲鎮全境、佳里鎮、鹽水鎮、北門鄉鄰近村落。
上白礁舉行時間為每年農曆的三月十一日,當日清晨依古禮先向廟中的保生大帝及眾神恭讀祝文之後,香陣依序出發。在先鋒陣之後,即是臺南五大刈香活動中必能看到的百足真人——蜈蚣陣,是目前唯一保持以人力扛運的蜈蚣陣。此外,保生大帝的神轎的特色,是以雕飾華麗的大型「輦宮」供神明乘坐。上白礁的重點除了是恭迎保生大帝之神靈回白礁謁祖之外,學甲十三庄的居民亦在將軍河畔遙祭「中華民族列祖列宗」,並在法師的帶領之下舉行「請水、火」儀式,亦是象徵將白礁慈濟宮祖廟的香火,請回學甲慈濟宮奉祀。